Laboratorio de Biología Molecular

Departamento de Producción Agrícola y Animal

Universidad Autónoma Metropolitana Unidad Xochimilco

http://www.xoc.uam.mx

 

Objetivos y metas

Incorporar las tecnologías moleculares en los estudios de nutrición animal para evaluaciones nutrigenomicas y del microbioma.

  • 1 tesis doctoral
  • 1 tesis de maestría
  • 2 artículos indexados JCR 

 

Líneas de investigación

  • Ecología microbiana de procesos biotecnológicos y ambientales: Un enfoque molecular.
  • Análisis de la funcionalidad del género Bífidobacterium en el intestino.
  • Evaluación y desarrollo de estrategias nutricionales para mejorar la eficiencia de utilización del alimento en ovinos
  • Producción y caracterización de enzimas bacterianas y fúngicas para su uso en biotecnología animal
  • Evaluación y desarrollo de estrategias nutricionales para reducir la emisión de gases de efecto invernadero en la producción pecuaria. 

 

Líneas estratégicas 

  • Estudio de nutrientes y cambios en la composición de las comunidades bacterianas del tracto gastrointestinal de animales domésticos y silvestres
  • Evaluación de nutrientes en la expresión de genes relacionados al metabolismo de energía y proteína
  • Desarrollo de enzimas exógenas fibrolíticas para rumiantes  

 

Proyectos  

  • Interacción de ionóforos y granos de distinta tasa de fermentación en la diversidad bacteriana ruminal
  • Efecto de la suplementación mineral en la diversidad bacteriana y la digestibilidad en caballos
  • Efectos de niveles dietarios de aceite de pescado en el comportamiento de corderos, fermentación ruminal y la expresión gen de la leptina
  • Efectos de los niveles de grano en el comportamiento productivo de ovinos en finalización,  metabolismo ruminal y la expresión del ARNm de leptina
  • Efectos de colina y metionina ruminalmente protegida en el crecimiento y expresión de genes relacionados al metabolismo de energía  

 

Servicios  

  • Análisis  de diversidad por medio de análisis de desnaturalización de cadenas (High Resolution Melt) en muestras de ADN de digesta, excretas o liquido ruminal.
  • Conteo de microorganismos por copias de genoma a través de PCR en Tiempo real (qRT-PCR) 
  • Análisis de expresión de genes en muestras de tejido por medio de qRT-PCR
  • Secuenciación de ADN por marcaje fluorescente de cadenas (300 pb en promedio)
  • Identificación de especie por PCR a partir de muestras de excretas (jaguar y puma)  

 

Integrantes  

  • Germán David Mendoza Martínez. Nivel III. Departamento de Producción Agrícola y Animal.
  • Daniel Martínez Gómez. Nivel I. Departamento de Producción Agrícola y Animal.
  • Octavio Loera Corral. Nivel III.  Departamento de Biotecnología.
  • Hugo Cesar Ramírez Saad. Nivel I. Departamento de Sistemas Biológicos. 
  • José Antonio Martínez García. Nivel I. Departamento de Producción Agrícola y Animal.
  • Estela Teresita Méndez Olvera. Departamento de Producción Agrícola y Animal. 

 

Especies de estudio

  • Bacterias ruminales con la técnica de gas in vitro
  • Rumiantes (corderos, bovinos)
  • No rumiantes (equinos, conejos)
  • Especies silvestres (Ambytsoma mexicanum, Romerolagusdiazi).

 

Publicaciones recientes 

  • Mendoza GD, O Loera C,  FX Plata, PA Hernández, M Ramírez. 2014. Considerations on the use of exogenous fibrolytic enzymes to improve forage utilization. The Scientific World Journal Volume 2014, Article ID 247437, 9 pages http://dx.doi.org/10.1155/2014/247437
  • Arce CO,  M Saucedo,  H Leal,  R Ramírez,  F Cruz,  O Loera. 2015. Alternative supplements for Agaricus bisporus production and the response on lignocellulolytic enzymes. Scientia Horticulturae  192:375-380.
  • Sunny A,  Monroy-Vilchis O, Zarco GM, Mendoza MGD, Martìnez GD. 2015. Genetic diversity and genetic structure of an endemic Mexican Dusky Rattlesnake (Crotalus triseriatus) in a highly modified agricultural landscape: implications for conservation. Genetica DOI 10.1007/s10709-015-9868-8
  • Campos M.R., Mendoza  G.D., Ojeda J., Plata F.X., Martínez J.A. 2015. The Effect of Saccharomyces cerevisiae on Digestion and Mortality in the Volcano Rabbit (Romerolagus diazi). Journal of Integrative Agriculture 14(3) Doi:10.1016/S2095-3119(14)60828-5
  • Hernández G.PA., A. Lara, G.D. Mendoza, J.R. Bárcena, F.X. Plata, R. López, J.A. Martínez. 2015. Effects of feeding yeast (Saccharomyces cerevisiae), organic selenium and chromium mixed on growth performance and carcass traits of hair lambs. Journal of Integrative Agriculture 14(3):575-582.
  • Hernández P.A., G.D. Mendoza, R. Bárcena, M.C. Montes and J.A. Martínez. 2014. Effect of a xylanolytic enzymatic extract from Cellulomonas flavigena on in situ ruminal digestion of agricultural wastes. Animal Nutrition and Feed Technology 14: 481-488.
  • Cruz A, Schahrasad M, Melendez A, Reyes CPA, Chavaro PDA, Azaola EA, Mayorga RL. 2014. Impacto de la obesidad en la población y su relación con la microbiota intestinal. Revista Mexicana de Ciencias Farmacéuticas 45: 9-18.
  • Rueda P., Mendoza G.D., Martínez D., Rosas-Rosas O. 2013. Determination of the jaguar (Panthera onca) and puma (Puma concolor) diet in a tropical forest in San Luis Potosi, Mexico. Journal of Applied Animal Research 41(4):484-489.
  • Torres N., G.D. Mendoza, J.R. Bárcena, S.S. González, O. Loera, A.Z.M. Salem and A. Lara. 2013. Effect of a fibrolytic enzymatic extract from Cellulomonas flavigena on in vitro degradation and in vivo digestibility and productive performance of lambs. Animal Nutrition and Feed Technology 13(3):583-592.
  • Tzintzun CO, Loera O, Ramírez SHC, Gutiérrez RM. 2012. Comparison of mechanisms of hexadecane uptake among pure and mixed cultures derived from a bacterial consortium. International Biodeterioration and Biodegradation 70:  1-7.